Nature Methods:从“平面战争”到“立体战场”!体外肿瘤模型的百年进化史
从二维到三维,再到超越三维,体外肿瘤模型的演进之路,不仅是一部技术迭代的历史,更是一场深刻的科学思想变革。
Nature Methods:长读长测序“去伪存真”!SAVANA如何颠覆癌症基因组分析的传统认知?
SAVANA让我们能够以前所未有的精度,窥探癌症基因组的“变形记”,从而为开发更有效的诊断方法、更精准的治疗方案,乃至最终战胜癌症,奠定了坚实的基础。
Nature Methods:“双剑合璧”!SUM-seq重塑单细胞多组学图谱,引领科研新范式
SUM-seq作为一项创新的单细胞多组学分析技术,以其前所未有的成本效益、可扩展性和超高通量,超越了现有方法在同时捕获染色质可及性和基因表达方面的表现。
Nature Methods:从“猜”到“预见”——AI模型PUPS揭示单细胞蛋白质定位的秘密
PUPS作为一款结合蛋白质序列和细胞图像的新型AI模型,不仅能准确预测未知蛋白质在未知细胞系中的定位,还能揭示蛋白质定位在不同细胞系和单细胞层面的变异规律,甚至预测突变对定位的影响。
Nature Methods:解锁植物细胞壁“功能地图”!“碳标签”——活体感知软硬、酸碱与信号
研究人员开发出一种名为“碳标签”(CarboTag)的创新模块化工具箱。它是一个巧妙的小分子,能够像“导航仪”一样精准、快速地将各种探针分子靶向并结合到活体植物及藻类的细胞壁上,且对细胞毒性极低。
Nature Methods:结构为桥,语境为王——Spacedust在de novo基因簇发现中的新范式
研究人员开发了一款名为“Spacedust”的计算工具,它不像传统的解码器那样逐字破解,而是通过倾听基因组中基因之间的“悄悄话”,即它们在染色体上的排列组合方式,来推断其功能。
Nature Methods:告别聚类“玄学”!TCAT为T细胞研究带来可定量、可比较的分析新时代
研究人员,开发出一种名为T细胞注释器(T-CellAnnoTator, TCAT)的创新分析流程。它不仅仅是一种新工具,更是一种全新的思维范式,旨在为混乱的T细胞单细胞数据世界建立秩序。
Nature Methods:结构为桥,语境为王!Spacedust在de novo基因簇发现中的新范式
研究人员开发了一款名为“Spacedust”的计算工具,它不像传统的解码器那样逐字破解,而是通过倾听基因组中基因之间的“悄悄话”,即它们在染色体上的排列组合方式,来推断其功能。
Nature Methods:细胞内的“隐身信使”之如何让单个RNA分子在万千背景中“亮”起来
研究人员开发出了一套全新的RNA成像工具,它如同拥有了“智能识别”系统,只有在与目标RNA结合时才能稳定存在,一旦脱离目标,就会被细胞内的“清洁工”,蛋白酶体(proteasome),迅速降解。
Nature Methods:颠覆认知的疾病机制革命!
随着生命科学的不断进步,人类正在突破线性序列的桎梏。可以看到,一个全新的领域已然开启:也许未来的精准医疗,会从给每个患者的基因组绘制专属的“四维折叠地图”开始。