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Nature Methods:细胞内的“隐身信使”之如何让单个RNA分子在万千背景中“亮”起来

研究人员开发出了一套全新的RNA成像工具,它如同拥有了“智能识别”系统,只有在与目标RNA结合时才能稳定存在,一旦脱离目标,就会被细胞内的“清洁工”,蛋白酶体(proteasome),迅速降解。

2025-09-26

Nature Methods:结构为桥,语境为王!Spacedust在de novo基因簇发现中的新范式

研究人员开发了一款名为“Spacedust”的计算工具,它不像传统的解码器那样逐字破解,而是通过倾听基因组中基因之间的“悄悄话”,即它们在染色体上的排列组合方式,来推断其功能。

2025-09-22

Nature Methods:结构为桥,语境为王——Spacedust在de novo基因簇发现中的新范式

研究人员开发了一款名为“Spacedust”的计算工具,它不像传统的解码器那样逐字破解,而是通过倾听基因组中基因之间的“悄悄话”,即它们在染色体上的排列组合方式,来推断其功能。

2025-09-20

Nature Methods:告别聚类“玄学”!TCAT为T细胞研究带来可定量、可比较的分析新时代

研究人员,开发出一种名为T细胞注释器(T-CellAnnoTator, TCAT)的创新分析流程。它不仅仅是一种新工具,更是一种全新的思维范式,旨在为混乱的T细胞单细胞数据世界建立秩序。

2025-09-11

Nature Methods:从“平面战争”到“立体战场”!体外肿瘤模型的百年进化史

从二维到三维,再到超越三维,体外肿瘤模型的演进之路,不仅是一部技术迭代的历史,更是一场深刻的科学思想变革。

2025-08-01

Nature Methods:一细胞,双视角!SDR-seq高通量解析遗传变异对基因表达的精细调控

SDR-seq技术的出现,为我们提供了一个前所未有的新“罗盘”。它不仅能将我们精确地导航到那片森林,还能让我们直接走进每一户人家,亲眼看到他们的炉灶 (基因型) 和锅里煮着的食物 (基因表达)。

2025-09-04

Nature Methods:当深度学习遇见纯净数据,DeepMVP为精准医学画出蛋白质功能新图谱

研究人员将DeepMVP应用于癌症基因组图谱(TCGA)中超过79万个癌症体细胞突变,预测发现其中高达31%的突变会显著改变PTM。

2025-08-30

Nature Methods:算法的胜利!不更换硬件,如何将成像质谱流式(IMC)分辨率推向350纳米?

研究团队巧妙地“绕过”了硬件的限制,通过一种创新的“过采样-再重建”策略,将成像质谱流式技术(IMC)的分辨率提升到了惊人的350纳米(nm)以下,成功推开了通往细胞内部纳米世界的大门。

2025-11-04

Nature Methods:化繁为简!nELISA如何以可扩展、低成本的方案开启精准蛋白质组学研究新纪元

nELISA的问世,不仅仅是又一项高性能分析工具的诞生。它通过一系列巧妙的设计,成功地在多重性、特异性、通量、灵敏度和成本效益这几个长期以来相互制约的维度之间,找到了一个前所未有的最佳平衡点。

2025-11-12

Nature Methods:解码肿瘤的“千人千面”——Clonalscope,一把洞悉癌细胞演化迷局的钥匙

在与癌症的漫长博弈中,我们第一次拥有了如此清晰的视野,去洞察对手的“千人千面”。而这,仅仅是一个开始。

2025-09-24